Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 35.9□□□□□ -1.466e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 55.9□□□□□ -1.466e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 25.4□□□□□ -1.556e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 25.26□□□□□ -1.576e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.626e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 34.96□□□□□ -1.626e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 24.96□□□□□ -1.626e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 34.44□□□□□ -1.76e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 53.42□□□□□ -1.866e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 23.21□□□□□ -1.96e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 23.17□□□□□ -1.96e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.926e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.046e-11■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 COL9A3-213ENST00000489045 838 ntTSL 514.21□□□□□ -0.132e-8■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 COL9A3-211ENST00000477612 635 ntTSL 313.47□□□□□ -0.252e-8■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 COL9A3-202ENST00000452372 596 ntTSL 512.27□□□□□ -0.452e-8■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.982e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-215ENST00000546191 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.172e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.052e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.052e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.192e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.22e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.212e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-9■■□□□ 12.1
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SRSF9Q13242 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.312e-9■■□□□ 12.1
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SRSF9Q13242 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.382e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-9■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 PLXNB1-218ENST00000485535 3264 ntTSL 29.51□□□□□ -0.892e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.972e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.074e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.134e-6■■□□□ 12.1
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SRSF9Q13242 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.434e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-6■■□□□ 12.1
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SRSF9Q13242 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 48.4□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 12.1
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SRSF9Q13242 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)8.04□□□□□ -1.124e-6■■□□□ 12.1
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SRSF9Q13242 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 57.26□□□□□ -1.254e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ACSF3-210ENST00000538340 434 ntTSL 56.99□□□□□ -1.294e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ABCC2-201ENST00000370434 1714 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.34e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ARPC4-TTLL3-203ENST00000424442 903 ntTSL 56.84□□□□□ -1.314e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 TTLL3-219ENST00000452597 603 ntTSL 46.84□□□□□ -1.314e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ARPC4-TTLL3-202ENST00000418163 551 ntTSL 46.57□□□□□ -1.364e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 36.49□□□□□ -1.374e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 TTLL3-217ENST00000439814 497 ntTSL 45.8□□□□□ -1.484e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 TTLL3-216ENST00000438596 540 ntTSL 54.48□□□□□ -1.694e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 44.23□□□□□ -1.734e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 33.04□□□□□ -1.924e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 32.68□□□□□ -1.984e-6■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-7■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.086e-7■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.056e-7■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.126e-7■■□□□ 12.1
SRSF9Q13242 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.73e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 OSTM1-203ENST00000467960 764 ntTSL 315.06■□□□□ 01e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-209ENST00000554947 1203 ntTSL 214.91□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 ANKRD20A5P-205ENST00000581181 1180 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-216ENST00000556175 775 ntTSL 313.37□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 12
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