Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRJQ12913 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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