Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPARDQ03181 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms