Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX2Q02962 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms