Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CSNK2A1P68400 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A1P68400 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms