Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113P62684 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms