Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC3P51654 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC3P51654 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC3P51654 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC3P51654 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC3P51654 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC3P51654 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC3P51654 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC3P51654 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC3P51654 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC3P51654 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC3P51654 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC3P51654 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC3P51654 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC3P51654 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC3P51654 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC3P51654 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC3P51654 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC3P51654 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC3P51654 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC3P51654 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC3P51654 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC3P51654 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC3P51654 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC3P51654 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms