Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG1BP48304 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
REG1BP48304 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
REG1BP48304 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
REG1BP48304 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG1BP48304 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG1BP48304 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG1BP48304 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG1BP48304 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG1BP48304 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
REG1BP48304 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
REG1BP48304 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
REG1BP48304 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
REG1BP48304 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
REG1BP48304 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
REG1BP48304 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
REG1BP48304 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms