Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA4P43358 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MAGEA4P43358 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms