Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD10P28358 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms