Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO2P25791 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO2P25791 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO2P25791 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO2P25791 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO2P25791 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO2P25791 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO2P25791 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO2P25791 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO2P25791 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO2P25791 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO2P25791 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO2P25791 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO2P25791 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO2P25791 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO2P25791 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO2P25791 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO2P25791 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO2P25791 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO2P25791 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO2P25791 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO2P25791 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO2P25791 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO2P25791 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO2P25791 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO2P25791 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO2P25791 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMO2P25791 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMO2P25791 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO2P25791 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms