Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms