Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2P04141 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2P04141 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2P04141 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSF2P04141 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2P04141 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2P04141 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2P04141 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2P04141 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2P04141 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2P04141 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2P04141 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2P04141 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2P04141 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2P04141 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms