Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN7O94888 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms