Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP2O75044 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms