Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN1O60635 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms