Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP73O15350 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP73O15350 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP73O15350 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP73O15350 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP73O15350 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP73O15350 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP73O15350 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP73O15350 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP73O15350 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP73O15350 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP73O15350 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TP73O15350 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TP73O15350 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP73O15350 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP73O15350 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP73O15350 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP73O15350 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP73O15350 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP73O15350 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP73O15350 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP73O15350 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms