Protein–RNA interactions for Protein: B2RV13

C17orf105, Uncharacterized protein C17orf105, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf105B2RV13 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf105B2RV13 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf105B2RV13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms