Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms