Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHB6Q9Y5E3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB6Q9Y5E3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms