Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HES2Q9Y543 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms