Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHA12Q9UN75 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms