Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms