Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.377e-7■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.167e-7■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-7■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 212.81□□□□□ -0.363e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 510.38□□□□□ -0.753e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 RNASET2-211ENST00000509073 433 ntTSL 26.96□□□□□ -1.33e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.719e-7■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.389e-7■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 TMED7-203ENST00000508420 572 ntTSL 419.94■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 TMED7-202ENST00000503010 805 ntTSL 214.07□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 12
NOL12Q9UGY1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.85e-6■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.34e-7■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.84e-7■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.814e-7■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.942e-15■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.372e-15■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 APOC3-204ENST00000470144 269 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-15■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-15■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 APOC3-203ENST00000433777 359 ntTSL 59.28□□□□□ -0.922e-15■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 216.79■□□□□ 0.284e-6■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 219.53■□□□□ 0.722e-6■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 SLC6A8-210ENST00000485324 2401 ntTSL 223.31■■□□□ 1.323e-7■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 SLC6A8-202ENST00000413787 468 ntTSL 516.59■□□□□ 0.253e-7■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 512.72□□□□□ -0.371e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 512.04□□□□□ -0.481e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 211.98□□□□□ -0.491e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.651e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 310.4□□□□□ -0.741e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 58.27□□□□□ -1.091e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 57.81□□□□□ -1.161e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 27.44□□□□□ -1.221e-323■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 PRKCSH-216ENST00000592445 598 ntTSL 216.29■□□□□ 0.25e-6■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 PRKCSH-201ENST00000585325 598 ntTSL 411.99□□□□□ -0.495e-6■■□□□ 11.9
NOL12Q9UGY1 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.6□□□□□ -1.191e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.051e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 514.9□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 215.38■□□□□ 0.053e-9■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 312.94□□□□□ -0.343e-9■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.913e-9■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.143e-9■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 25.58□□□□□ -1.523e-9■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 59.23□□□□□ -0.937e-7■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.987e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.977e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.737e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.697e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.667e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.417e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.367e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 CYTH2-201ENST00000325139 1087 ntTSL 223.11■■□□□ 1.297e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.267e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)22.5■■□□□ 1.197e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 CYTH2-202ENST00000391881 1546 ntTSL 522.44■■□□□ 1.187e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 WDR90-222ENST00000552683 2342 ntTSL 222.15■■□□□ 1.147e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.147e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HLA-G-206ENST00000478355 1525 nt22.07■■□□□ 1.127e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 WDR90-224ENST00000552943 5498 ntTSL 1 (best)22.03■■□□□ 1.127e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-212ENST00000460424 538 ntTSL 421.62■■□□□ 1.057e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.027e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 17e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 321.29■■□□□ 17e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.987e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.947e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-218ENST00000489559 579 ntTSL 420.74■□□□□ 0.917e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 520.59■□□□□ 0.897e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.877e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.827e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.827e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HLA-G-207ENST00000478519 1175 nt20.16■□□□□ 0.827e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.817e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 220.02■□□□□ 0.797e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.797e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.797e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.777e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.757e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.727e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.717e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.697e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.04■□□□□ 0.647e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.637e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 318.93■□□□□ 0.627e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-206ENST00000423611 877 ntTSL 318.8■□□□□ 0.67e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.67e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 318.52■□□□□ 0.567e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.557e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.527e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 ARHGEF1-217ENST00000598812 588 ntTSL 518.15■□□□□ 0.57e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 PLOD3-213ENST00000478264 663 ntTSL 217.98■□□□□ 0.477e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 WDR90-223ENST00000552728 3133 ntTSL 517.91■□□□□ 0.467e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.437e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 517.67■□□□□ 0.427e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 HGS-216ENST00000576498 1004 ntTSL 217.21■□□□□ 0.357e-6■■□□□ 11.8
NOL12Q9UGY1 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 217.16■□□□□ 0.347e-6■■□□□ 11.8
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 362.8 ms