RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598812.5

ARHGEF1-217, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF1, Length 588 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-217ENST00000598812 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.75■■■■■ 5.39
ARHGEF1-217ENST00000598812 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.56■■■■■ 4.56
ARHGEF1-217ENST00000598812 ABCC9O60706 1549 aa43.37■■■■■ 4.53
ARHGEF1-217ENST00000598812 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF1-217ENST00000598812 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.26■■■■■ 4.2
ARHGEF1-217ENST00000598812 NACADO15069 1562 aa41.08■■■■■ 4.17
ARHGEF1-217ENST00000598812 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.01■■■■■ 4.16
ARHGEF1-217ENST00000598812 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.66■■■■■ 4.1
ARHGEF1-217ENST00000598812 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF1-217ENST00000598812 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.3■■■■■ 4.04
ARHGEF1-217ENST00000598812 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.28■■■■■ 4.04
ARHGEF1-217ENST00000598812 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.22■■■■■ 4.032e-6■■□□□ 12.9
ARHGEF1-217ENST00000598812 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.98■■■■□ 3.99
ARHGEF1-217ENST00000598812 SCRIBQ14160 1630 aa39.73■■■■□ 3.95
ARHGEF1-217ENST00000598812 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.56■■■■□ 3.92
ARHGEF1-217ENST00000598812 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.22■■■■□ 3.87
ARHGEF1-217ENST00000598812 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF1-217ENST00000598812 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
ARHGEF1-217ENST00000598812 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.52■■■■□ 3.76
ARHGEF1-217ENST00000598812 SMARCA4P51532 1647 aa37.94■■■■□ 3.66
ARHGEF1-217ENST00000598812 NCAPD3P42695 1498 aa37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF1-217ENST00000598812 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.85■■■■□ 3.65
ARHGEF1-217ENST00000598812 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF1-217ENST00000598812 SMARCA2P51531 1590 aa37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF1-217ENST00000598812 CUX2O14529 1486 aa37.77■■■■□ 3.64
ARHGEF1-217ENST00000598812 HMGXB3Q12766 1538 aa37.68■■■■□ 3.62
ARHGEF1-217ENST00000598812 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF1-217ENST00000598812 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF1-217ENST00000598812 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF1-217ENST00000598812 ERCC6Q03468 1493 aa37.45■■■■□ 3.59
ARHGEF1-217ENST00000598812 NESP48681 1621 aa37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF1-217ENST00000598812 WIZO95785 1651 aa37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF1-217ENST00000598812 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37■■■■□ 3.51
ARHGEF1-217ENST00000598812 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF1-217ENST00000598812 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF1-217ENST00000598812 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.79■■■■□ 3.48
ARHGEF1-217ENST00000598812 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.79■■■■□ 3.48
ARHGEF1-217ENST00000598812 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
ARHGEF1-217ENST00000598812 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF1-217ENST00000598812 CFTRP13569 1480 aa36.46■■■■□ 3.43
ARHGEF1-217ENST00000598812 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF1-217ENST00000598812 TRIM41Q8WV44 630 aa36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF1-217ENST00000598812 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF1-217ENST00000598812 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF1-217ENST00000598812 WDR62O43379 1518 aa36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF1-217ENST00000598812 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF1-217ENST00000598812 PRDM2Q13029 1718 aa36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF1-217ENST00000598812 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF1-217ENST00000598812 TOPBP1Q92547 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF1-217ENST00000598812 ABCC8Q09428 1581 aa35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF1-217ENST00000598812 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF1-217ENST00000598812 OSCARQ8IYS5 282 aa35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF1-217ENST00000598812 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF1-217ENST00000598812 IFT140Q96RY7 1462 aa35.64■■■■□ 3.3
ARHGEF1-217ENST00000598812 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.57■■■■□ 3.29
ARHGEF1-217ENST00000598812 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.57■■■■□ 3.29
ARHGEF1-217ENST00000598812 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.57■■■■□ 3.29
ARHGEF1-217ENST00000598812 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.27
ARHGEF1-217ENST00000598812 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF1-217ENST00000598812 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF1-217ENST00000598812 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF1-217ENST00000598812 ARHGEF11O15085 1522 aa35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF1-217ENST00000598812 CUX1P39880 1505 aa35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF1-217ENST00000598812 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.231e-6■■■■■ 35
ARHGEF1-217ENST00000598812 SOGA1O94964 1423 aa35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF1-217ENST00000598812 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF1-217ENST00000598812 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF1-217ENST00000598812 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF1-217ENST00000598812 WDR97A6NE52 1622 aa35.07■■■■□ 3.21
ARHGEF1-217ENST00000598812 CHD1O14646 1710 aa35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF1-217ENST00000598812 FBLN2P98095 1184 aa34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF1-217ENST00000598812 ARAP1Q96P48 1450 aa34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF1-217ENST00000598812 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF1-217ENST00000598812 GRIN2BQ13224 1484 aa34.9■■■■□ 3.18
ARHGEF1-217ENST00000598812 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.9■■■■□ 3.18
ARHGEF1-217ENST00000598812 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
ARHGEF1-217ENST00000598812 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF1-217ENST00000598812 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF1-217ENST00000598812 TOP2BQ02880 1626 aa34.84■■■■□ 3.17
ARHGEF1-217ENST00000598812 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.84■■■■□ 3.17
ARHGEF1-217ENST00000598812 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.83■■■■□ 3.17
ARHGEF1-217ENST00000598812 SYNJ1O43426 1573 aa34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF1-217ENST00000598812 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF1-217ENST00000598812 PBRM1Q86U86 1689 aa34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF1-217ENST00000598812 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF1-217ENST00000598812 SYNJ2O15056 1496 aa34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF1-217ENST00000598812 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF1-217ENST00000598812 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF1-217ENST00000598812 ADAMTS12P58397 1594 aa34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF1-217ENST00000598812 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.45■■■■□ 3.11
ARHGEF1-217ENST00000598812 GRIN2AQ12879 1464 aa34.45■■■■□ 3.1
ARHGEF1-217ENST00000598812 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF1-217ENST00000598812 NUP160Q12769 1436 aa34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF1-217ENST00000598812 CEP170Q5SW79 1584 aa34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF1-217ENST00000598812 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF1-217ENST00000598812 KIF27Q86VH2 1401 aa34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF1-217ENST00000598812 IGF1RP08069 1367 aa34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF1-217ENST00000598812 SHROOM2Q13796 1616 aa34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF1-217ENST00000598812 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF1-217ENST00000598812 CUL7Q14999 1698 aa34.06■■■■□ 3.04
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