Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL17Q9NRX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL17Q9NRX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms