Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms