Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA2

PATE1, Prostate and testis expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE1Q8WXA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE1Q8WXA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE1Q8WXA2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms