Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MLIPQ5VWP3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MLIPQ5VWP3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms