Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms