Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A9Q2M3M2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A9Q2M3M2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms