Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA9Q16790 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA9Q16790 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA9Q16790 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA9Q16790 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA9Q16790 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA9Q16790 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA9Q16790 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CA9Q16790 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA9Q16790 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA9Q16790 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA9Q16790 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA9Q16790 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA9Q16790 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA9Q16790 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA9Q16790 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA9Q16790 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CA9Q16790 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA9Q16790 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA9Q16790 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA9Q16790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA9Q16790 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA9Q16790 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA9Q16790 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA9Q16790 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA9Q16790 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA9Q16790 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA9Q16790 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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