Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CGNL1Q0VF96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms