Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGM3Q08188 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms