Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH1Q08174 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH1Q08174 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDH1Q08174 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDH1Q08174 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms