Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPD2P62316 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms