Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VCPP55072 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPP55072 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPP55072 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPP55072 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPP55072 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPP55072 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPP55072 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPP55072 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPP55072 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPP55072 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPP55072 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPP55072 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPP55072 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPP55072 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPP55072 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPP55072 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPP55072 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPP55072 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPP55072 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPP55072 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPP55072 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPP55072 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPP55072 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPP55072 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPP55072 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPP55072 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPP55072 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPP55072 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPP55072 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPP55072 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPP55072 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPP55072 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPP55072 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPP55072 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPP55072 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPP55072 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPP55072 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms