Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN1CP49918 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN1CP49918 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms