Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A3P48751 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms