Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKA1P46020 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHKA1P46020 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms