Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT2P35908 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT2P35908 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT2P35908 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT2P35908 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT2P35908 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT2P35908 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT2P35908 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT2P35908 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT2P35908 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT2P35908 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT2P35908 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT2P35908 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT2P35908 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT2P35908 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT2P35908 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT2P35908 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT2P35908 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT2P35908 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT2P35908 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT2P35908 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT2P35908 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT2P35908 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT2P35908 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT2P35908 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT2P35908 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT2P35908 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT2P35908 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT2P35908 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT2P35908 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT2P35908 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT2P35908 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT2P35908 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT2P35908 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT2P35908 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT2P35908 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT2P35908 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT2P35908 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT2P35908 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT2P35908 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT2P35908 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT2P35908 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT2P35908 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT2P35908 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT2P35908 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT2P35908 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT2P35908 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT2P35908 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms