Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME1P15531 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME1P15531 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME1P15531 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME1P15531 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME1P15531 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME1P15531 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME1P15531 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME1P15531 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME1P15531 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME1P15531 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME1P15531 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME1P15531 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME1P15531 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME1P15531 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME1P15531 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME1P15531 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME1P15531 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NME1P15531 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME1P15531 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME1P15531 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME1P15531 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME1P15531 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME1P15531 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME1P15531 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME1P15531 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME1P15531 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME1P15531 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME1P15531 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME1P15531 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME1P15531 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME1P15531 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME1P15531 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME1P15531 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms