Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6CP09669 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6CP09669 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6CP09669 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6CP09669 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6CP09669 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6CP09669 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6CP09669 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6CP09669 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6CP09669 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6CP09669 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6CP09669 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6CP09669 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6CP09669 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6CP09669 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6CP09669 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6CP09669 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6CP09669 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6CP09669 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms