Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP3O75386 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP3O75386 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP3O75386 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP3O75386 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP3O75386 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP3O75386 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP3O75386 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP3O75386 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP3O75386 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP3O75386 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP3O75386 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP3O75386 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP3O75386 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP3O75386 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP3O75386 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP3O75386 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP3O75386 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP3O75386 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP3O75386 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP3O75386 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP3O75386 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP3O75386 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP3O75386 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP3O75386 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP3O75386 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP3O75386 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP3O75386 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP3O75386 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP3O75386 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP3O75386 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP3O75386 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP3O75386 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP3O75386 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP3O75386 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP3O75386 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP3O75386 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP3O75386 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP3O75386 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP3O75386 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP3O75386 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP3O75386 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.1 ms