Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
N4BP3O15049 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms