Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDMT1O14717 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDMT1O14717 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms