Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms