Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX4Q9Y2E6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms