Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOD1Q9Y239 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms