Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PLXNA1Q9UIW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms